Maaike Kooijman
01 juni 2026, 13:02

Bacteriën, schimmels en gisten kunnen de grote problemen in de landbouw oplossen (én voor nieuwe verdienmodellen zorgen)

Bacteriën, schimmels en gisten hebben de potentie om de landbouw duurzamer en de economie circulairder te maken. Een nieuwe publiek-private samenwerking moet daar invulling aan geven. ‘Microbiomen kunnen helpen om het stikstofprobleem, de afname van biodiversiteit én de slechte waterkwaliteit op te lossen.’

Holomicrobioom Innovatie Instituut 1 Microbiomen zijn gemeenschappen van micro-organismen, zoals schimmels, bacteriën en gisten. | Credits: Holomicrobioom Instituut

Bij schimmels, bacteriën en virussen denken we al snel aan ziektes en bedorven voedsel. Micro-organismen hebben geen al te beste reputatie, weet ook hoogleraar systeembiologie Bas Teusink. Het afgelopen woensdag geopende Holomicrobioom Instituut, waar Teusink wetenschappelijk directeur van is, moet daar verandering in brengen. ‘Micro-organismen zijn onmisbaar voor duurzame landbouw en de circulaire economie.’

Microbiomen als oplossing van het stikstofprobleem

Het Holomicrobioom Instituut is geen kennisinstituut, maar een innovatie-instituut, zegt Teusink. Want hoewel er ook nog flink wat gaten in de kennis zitten – die onderzoekers van Nederlandse universiteiten en hogescholen nu samen willen opvullen – is de vraag vooral hoe we microbiomen kunnen inzetten om de wereld en de mens gezonder te maken.

Bas Teusink (links) met algemeen directeur Jan Sikkema en valorisatiedirecteur Linda van de Burgwal.

Bas Teusink (links) met algemeen directeur Jan Sikkema en valorisatiedirecteur Linda van de Burgwal. | Credits: Holomicrobioom Instituut

Microbiomen zijn gemeenschappen van micro-organismen, zoals schimmels, bacteriën en gisten. Die zijn onmisbaar voor bodem, water, plant, dier en mens. Neem landbouwgrond, legt Teusink uit. Gewassen gaan een soort samenwerking aan met schimmels in de bodem. De plant geeft de schimmels voeding in de vorm van suikers; de schimmels halen in ruil daarvoor stikstof en fosfaat uit de bodem en geven die aan de plant.

Dat evenwicht hebben we verstoord door die stikstof en fosfaat aan de gewassen te geven in de vorm van kunstmest. Gewassen kunnen de suikers zo gebruiken om te groeien in plaats van aan de schimmels te geven. Klinkt efficiënt. Maar, benadrukt Teusink: ‘Daarmee put je de bodem uit. Dan worden gewassen vatbaarder voor schimmels en andere ziekteverwekkers, en daar heb je dan weer pesticiden voor nodig. Zo ontstaat een negatieve cyclus.’

Die negatieve cyclus kan een positieve worden als boeren meer samenwerken met de microbiomen in hun bodem. Teusink: ‘Dat kan helpen om veel grote problemen die we nu hebben op te lossen, zoals het stikstofprobleem, de afname van biodiversiteit en de slechte waterkwaliteit.’ Niet kunstmest, maar micro-organismen maken planten dan weerbaarder en voedzamer. Jaren geleden al ontdekten Utrechtse wetenschappers dat bodemmicroben de potentie hebben om planten immuun te maken voor ziekten.

Talloze duurzame toepassingen

Boeren moeten dan wel weten hoe hun bodem eruitziet. Meer kennis van microbiomen kan daarbij helpen, zegt Teusink. ‘Zodat we de bodem als het ware kunnen diagnosticeren. Op basis daarvan kun je kijken of er genoeg voedingsstoffen zijn voor planten hoe dat eventueel beter kan. Bijvoorbeeld door volgend jaar af te wisselen met een ander gewas.’

Je kunt dus naar microbiomen kijken om de gezondheid van bodem of water (of bijvoorbeeld de dikke darm bij mensen en dieren) te bepalen. Maar je kunt microbiomen ook actiever inzetten, zegt Teusink. Bijvoorbeeld in de vorm van probiotica: supplementen van levende bacteriën die een positief effect op de gezondheid van mens en dier.

De toepassingen zijn eindeloos. Je kunt micro-organismen bijvoorbeeld inzetten om nuttige voedingsstoffen uit afvalwater te zuiveren. Er wordt gekeken naar mogelijkheden om zaden te coaten met bepaalde micro-organismen zodat die beter ontkiemen en weerbaarder zijn. En we zouden dierlijke mest kunnen behandelen met micro-organismen zodat er minder stikstof vrijkomt. ‘Misschien kunnen we mest zelfs wel fermenteren met bepaalde starters van microben.’

Het Holomicrobioom Instituut verbindt dan ook niet alleen universiteiten en andere kennisinstellingen; ook het landbouwministerie en bedrijven als FrieslandCampina, Arla en Winclove Probiotics zijn aangesloten. Zij hebben baat bij versnelde innovaties om hun eigen voetafdruk te verkleinen, hun toeleveringsketen veilig te stellen of voor nieuwe verdienmodellen.

Credits: Holomicrobioom Instituut

Complexe samenwerking

Het instituut is gefinancierd met een bijdrage van 200 miljoen euro uit het Nationaal Groeifonds. Dat geld wordt deels gebruikt om onderzoeksprojecten te financieren. Hoewel er al veel data beschikbaar is, is er nog veel meer nodig, zegt Teusink. Microbiomen kunnen behoorlijk complex zijn. ‘Je kunt niet gewoon één organisme aan de bodem toevoegen en een wonder verwachten. Vaak gaat het om veel verschillende kleine beestjes die op een bepaalde manier op elkaar reageren.’

Ook de omgevingsfactoren zijn van grote invloed op het functioneren van zulke microbiomen. Teusink: ‘Soms werkt iets wel als het regent, maar niet als de zon schijnt.’

Perceptie veranderen

Naast het onderzoek en de technologische ontwikkeling is er ook budget om met ministeries, bedrijven en andere stakeholders om tafel te gaan voor echte systeemverandering. Om die redenen zijn er niet alleen bodemonderzoekers en gezondheidswetenschappers, maar ook sociale wetenschappers bij het hele project betrokken.

De uitdaging zit immers niet alleen in het onderzoek naar de micro-organismen zelf, maar ook in het veranderen van hoe de maatschappij daarnaar kijkt, zegt Teusink. ‘Bij virussen denken mensen altijd aan slecht nieuws, nu bijvoorbeeld aan ebola en het hantavirus. Maar als wij het over virussen hebben, bedoelen we virussen voor bacteriën. Voor mensen zijn die ongevaarlijk.’

Credits: Holomicrobioom Instituut

Die perceptie beïnvloedt uiteindelijk ook de wet- en regelgeving. Die is in Nederland niet gericht op microbiële toepassingen. Teusink: ‘Vaak worden die als gevaarlijk gezien, of vallen ze officieel onder de medicijnen, terwijl ze dat niet zijn.’

Ook bedrijven die gebruikmaken van micro-organismen voor nieuwe voedseltoepassingen lopen tegen obstakels aan. Onder meer de eiwitten van The Protein Brewery en de caseïne van Those Vegan Cowboys vallen onder de novel foods. Ze moeten door een jarenlang durend goedkeuringsproces voor ze op de Europese markt mogen worden verkocht.

Grote potentie

Het instituut heeft Teusink aangesteld als verbindende factor tussen ‘de mensen die meten, de mensen die écht willen begrijpen en de mensen die impact willen maken’. Maar de systeembioloog blijft ook zelf gefascineerd door de complexiteit én de potentie van microbiomen. ‘Hoe meer onderzoek ik naar ze doe, hoe meer ontzag ik voor ze krijg.’

Meer lezen over het voedselsysteem van de toekomst? In de nieuwsbrief Kweekvlees & Kool schrijft Change Inc.-redacteur Maaike Kooijman over nieuwe ontwikkelingen en interessante updates. Schrijf je hier in.

Lees ook:

Nieuwsupdate: Politie gaat elektrische auto's inzetten en kabinet neemt helft klimaatadviezen Burgerberaad over

Politie vervangt fossiele VW Golf door elektrische modellen De politie gaat vanaf deze zomer de fossiele variant van de Volkswagen Golf vervangen door twee elektrische alternatieven: de Cupra Born en de Skoda Enyaq. Eerstgenoemde wordt een voertuig voor toezicht en handhaving; de Enyaq gaat dienen als basisvoertuig, meldt Bright.Volgens de politie draagt de inzet van twee herkenbare elektrische modellen bij aan de duurzaamheidsdoelstellingen. Wel moet ze rekening houden met laadtijden. 'We zien in de data dat er voldoende tijd op een dag is om de auto te laden. Er een gewoonte van maken het voertuig na terugkomst aan de lader te hangen, zorgt ervoor dat de actieradius maximaal blijft tijdens een dienst', zegt sectorhoofd voer- en vaartuigen Peter Brouwer.Lees ook: Elektrische auto als batterij voor je huis of bedrijf: 8 dingen die je moet weten over bidirectioneel laden Donald Pols aan de slag bij Tata Nederland: 3 hete hangijzers Donald Pols start maandag als directeur duurzaamheid en communicatie bij Tata Steel Nederland. Zijn vertrek bij Milieudefensie leidde tot een stortvloed aan commentaren. Of Pols de grootste CO2-uitstoter van Nederland daadwerkelijk kan vergroenen, hangt af van een aantal lastige dossiers.Change Inc. analyseert drie grote uitdagingen: Pols moet de sluiting van de kooksfabrieken in goede banen leiden, zonder dat Tata Nederland financieel in de problemen komt; de maatwerkafspraak voor het Groen Staal-plan moet definitief worden; en als derde zal Pols met een geloofwaardige oplossing voor de milieurisico's van staalslakken moeten komen.Lees hier de hele analyse: 3 hete hangijzers voor Donald Pols bij de vergroening van de staalfabriek van Tata in IJmuiden Tweede Kamer moet vaart maken met bijmengplicht groen gas Netbeheer Nederland, de koepelorganisatie van de beheerders van energie-infrastructuur, roept de Tweede Kamer op tempo te maken met de behandeling van een wet die energieleveranciers verplicht tot een bijmengplicht voor groen gas. Officieel moet de wet per 1 januari 2027 ingaan, maar dan moeten de Tweede en Eerste Kamer wel voortvarend te werk gaan.Groen gas, dat verkregen wordt uit vergisting van biomassa, kan worden toegevoegd aan het bestaande pijpleidingennetwerk voor fossiel aardgas. Momenteel produceert Nederland zo'n 300 miljoen kuub groen gas per jaar. Doel van de nieuwe wet is om dat te laten oplopen naar 840 miljoen kuub in 2031. Als energieleveranciers een afnameplicht hebben, wordt het makkelijker om de productie van groen gas op te schalen, zo is de gedachte.Lees ook: Nederlandse productie groen gas stijgt met 14 procent in 2026 Kabinet neemt helft klimaatadviezen van Burgerberaad over Afgelopen jaar presenteerde het Nationaal Burgerberaad Klimaat een advies over klimaatmaatregelen op basis van inzichten van een groep van 175 burgers. In een officiële reactie laat het kabinet-Jetten weten dat de regering precies de helft van de 82 voorstellen uit het advies wil overnemen.Voorstellen waar het kabinet iets mee wil doen betreffen onder meer het toegankelijker maken van elektrisch rijden, reparaties beter toegankelijk en betaalbaar maken, en maatregelen tegen voedselverspilling. Tot de maatregelen die het kabinet niet overneemt, behoort een voorgestelde CO2-belasting voor de landbouw.Lees ook: Nederland is niet goed voorbereid op gevolgen klimaatverandering: zo worden we dat wel Wetenschappers laten oeroude bacteriën waterstof produceren Bedrijven en wetenschappers zijn hard op zoek naar manieren om waterstof te produceren zonder dat dat gepaard gaat met de uitstoot van broeikasgassen. Groene waterstof kun je verkrijgen door water met behulp van elektrolyse te splitsen, op basis van hernieuwbare stroom. Maar er zijn ook andere opties.Een team van onderzoekers in Duitsland en Portugal heeft een methode ontwikkeld om cyanobacteriën waterstof te laten produceren. De wetenschappers werken daarvoor met een combinatie van biologische en elektrochemische technologieën, meldt TW. De nieuwe onderzoeksresultaten zijn bemoedigend, maar er moeten nog diverse stappen worden gezet voordat commerciële toepassing in zicht komt.Lees ook: Industrie staat te springen om goedkopere groene waterstof: innovatieve Nederlandse elektrolysers bieden kansen Ook in de media:'Grote kans op een zeer warm jaar met meer dan 1,5 graden opwarming tussen nu en 2030'  (WMO) Wat is haalbaar bij duurzame gedragskeuzes?  'Leg een klein deel op je schouders' (NRC) Renault, Kia en Hyundai komen allemaal met elektrische auto's die stroom terugleveren aan het net (Nu.nl) VS investeren door AI-boom met datacenters meer in fossiele stroomcentrales dan China (Carbon Brief) Amerikaanse beurswaakhond SEC wil af van rapportageplicht voor bedrijven over klimaatrisico's (FT) Natuurmonumenten krijgt met Johan van der Gronden nieuwe voorzitter (NM) SkyNRG en KLM geven klap op bouw fabriek voor duurzame vliegtuigbrandstof in Delfzijl (KLM) Delftse bouwer van deels elektrisch vliegtuig Maeve failliet (Luchtvaartnieuws)